募集内容 |
参加枠1 無料
参加者数
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申込者 | 申込者一覧を見る |
開催日時 |
2021/07/14(水) 17:00 ~ 19:00
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募集期間 |
2021/06/18(金) 13:27
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会場 |
オンライン オンライン |
参加者への情報 |
(参加者と発表者のみに公開されます)
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イベントの説明
Bio"Pack"athon(バイオパッカソン)は、バイオのソフトウェアパッケージを作ることを推進するコミュニティです。
作るパッケージは主にBioconductorを想定しています。 (ただしCRAN, conda, PyPI, JuliaのパッケージでもOKです。) Bio"Pack"athonはBioconductorからBioconductorのコミュニティイベント(http://bioconductor.org/help/events/)の一つとして認識されています。
会の趣旨は日本バイオインフォマティクス学会ニュースレター第39号の7ページ目をご覧ください。
この回からBio"Pack"athonは変わります。 これまでは(主にBioconductor)パッケージの「作者を増やすこと」に注力していたのですが これからはパッケージ「作者となることに興味を持っていただくこと」に注力します。
これは
- ある程度パッケージ作者がBioPackathonから生まれた(その人達とはもうPackathonでパッケージングのノウハウを共有する必要が減った)
- 上記のコミュニティメンバーだけが常連のコミュニティとはしたくない
- 主に新たに加わられるメンバーに有益な情報を提供することにフォーカスしたい
といった背景からです。
新たな方針の会の第一回は Annotation Hubパッケージを再び紹介します。 これはこの話題が最もtwitterで注目を受けていたと思われるためです。 日本から生まれたAnnotation Hubパッケージの実用例も交えて新たなメンバーに向けた情報発信を心がけます。
またこれまで行っていたPackathon中の開発を廃止し、 新たなメンバーからの質問等を集めるための気軽な雑談に置き換えました。
(特に今後の)BioPackathonは「敷居が高くはありません」ので、ぜひお気軽にご参加ください。
ZoomのURLはconnpassの「参加者への情報」機能により本イベントページに表示されるようになっています。 その情報は
- 参加登録者でないと見れません
- connpassにログインしないと見れません
ご注意ください
スケジュール
17:00 ~ 17:10, Bio"Pack"athonの紹介 @kozo2
17:10 ~ 17:40, BioconductorのAnnotation Hubパッケージ(日本から生まれた複数実例の詳細も交えて)
17:40 ~ 18:10, データ前処理の便利関数einsumの解説 @antiplastics
18:10 ~ ???, 気軽な雑談
雑談議題案リスト
- AnnotationHubのデータがどのようなワークフローに使われているのかをざっくりつかむ方法はある?
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