Group Description

Bio"Pack"athon(バイオパッカソン)は、生命科学分野で利用されるデータベースや、データ解析手法を、各種プログラミング言語のパッケージとして実装し、オープンソースとして公開することを目的としたハッカソンです。使用言語は、今のところR、Julia、Pythonを想定しています。

下記のようなパッケージング作業を、情報を交換し互いにサポートし合うことを狙っています。

  1. 独自解析手法を開発したので、パッケージにして広く色々な人に使ってもらいたい
  2. Pythonで実装されたあるアルゴリズムを、Juliaパッケージとして再実装したい
  3. あるデータベースとのインターフェースをRパッケージで実装したい
  4. ラボ内で蓄積された独自データを、パッケージとして外部に公開したい
  5. 独自データを既にデータベースとして公開しているが、パッケージとしても公開したい、APIでもデータ取得できるようにしたい

現在のBio"Pack"athon(バイオパッカソン)でのキーワード: Rパッケージ, python ライブラリ, R-pythonプログラム翻訳, Julia, CRAN, Bioconductor, rOpenSci, pyOpenSci, tensor, 大規模データ処理, Out-Of-Memory, DelayedTensor, HDF5, バイオインフォマティクス, ゲノム解析, シングルセル解析, メタボローム, データベース, メタデータベース, メタデータ, 次元圧縮, PCA, PLS, PLS-ROG, OS-PCA, 遺伝的アルゴリズム(GA), webアプリ開発, LLM, chatGPT, GPT-4, LLM API, txt2img, 画像生成, バイオ画像解析, 深層学習, 機械学習, カーネル

※ 但し、本研究会の活動は上記に限定されません。

Slackワークスペース: biopackathon.slack.com (Slackの招待リンクは こちら になります。)

Upcoming Events

Public 2024/07/10(Wed) 17:00〜

Bio"Pack"athon 2024 #7

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オンライン

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Public 2024/09/20(Fri) 13:30〜

Bio"Pack"athon 2024 #9_1 Osaka Workshop (Day1)

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〒530-0011 大阪市北区大深町3-1 グランフロント大阪北館タワーC 9F

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Public 2024/09/21(Sat) 09:30〜

Bio"Pack"athon 2024 #9_2 Osaka Hackathon (Day2-5)

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〒534-0027 大阪市都島区中野町2-16-25

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Finished Events View all events (54)

Ended 2024/06/19(Wed) 17:00〜

Bio"Pack"athon 2024 #6

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オンライン

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Ended 2024/05/22(Wed) 17:00〜

【日程変更】Bio"Pack"athon 2024 #5

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Ended 2024/04/24(Wed) 17:00〜

Bio"Pack"athon 2024 #4

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Ended 2024/03/21(Thu) 17:00〜

Bio"Pack"athon 2024 #3

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10

Ended 2024/02/17(Sat) 14:30〜

Bio"Pack"athon 2024 #2

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Ended 2024/01/24(Wed) 17:00〜

【日程変更】Bio"Pack"athon 2024 #1

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Ended 2023/12/19(Tue) 17:00〜

Bio"Pack"athon 2023 #12

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Ended 2023/11/22(Wed) 17:00〜

Bio"Pack"athon 2023 #11

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9

Ended 2023/10/18(Wed) 17:00〜

Bio"Pack"athon 2023 #10

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Ended 2023/09/13(Wed) 17:00〜

Bio"Pack"athon 2023 #9

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